تأسست كلية الهندسة بصبراتة عام 1992م بعدد خمسة أقسام علمية هي قسم الهندسة الميكانيكية وقسم الهندسة الالكترونية بالاضافة إلى قسم الهندسة المدنية وقسم الهندسة الكهربائية وأخراً قسم الهندسة الكيميائية، وفي عام 2000م تم فتح قسم الهندسة البيئية والذي يعتبر أول قسم هندسي في الكليات الهندسية بالجامعات الليبية، وفي عام 2005م تم دمج قسم الهندسة الكهربائية وقسم الهندسة الالكترونية ليضم ثلاثة شعب هي شعبة القوى وشعبة الحاسب الالي وايضاً شعبة الاتصالات .
وبحلول عام 2016 تم فصل شعبة هندسة الحاسوب التابعة لقسم الهندسة الكهربائية والالكترونية لتصبح قسما مستقلاُ تحت أسم قسم هندسة الحاسوب وتقنية المعلومات
وفي العام 2017م تم إفتتاح قسم هندسة النفط كقسم مستقلا بذاته بعدما كان شعبة تابعة لقسم الهندسة الكيميائية. هذا وقد تم اعتماد نظام الفصل المفتوح للدراسة بالكلية منذ نشأتها.